Dr. Akgün, 1999 yılında İstanbul Üniversitesi İstanbul Tıp Fakültesi’nden mezun oldu. Tıpta Uzmanlık eğitimini 2005 yılında Marmara Üniversitesi Tıp Fakültesi Cerrahi Tıp Bilimleri Bölümü Ortopedi ve Travmatoloji Anabilim Dalı’nda tamamladı. 2003 yılında New York'ta bulunan Hospital for Special Surgery’de travma cerrahisi üzerine, 2010 yılında ise Yale University School of Medicine’da spor yaralanmaları üzerine klinik eğitim aldı.
2005 yılında “Tekrarlayan patellofemoral çıkıklarda modifiye Fulkerson osteotomisi ve sonuçları” başlıklı uzmanlık tezini sundu. 2022 yılında ise Marmara Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Beden Eğitimi ve Spor Anabilim Dalı’nda doktora eğitimini tamamladı. Doktora tezi “Sporda Sık Rastlanan Menisküs Yaralanmalarının Tedavisinde Cerrahların Operasyonel Hareketlerinin Video Analizi: Artroskopik El Becerisini Değerlendirmede Öncül Çalışma” başlığını taşımaktadır.
Türkiye Spor Yaralanmaları Artroskopi ve Diz Cerrahisi Derneği (TUSYAD), Türk Omuz ve Dirsek Cerrahisi Derneği (TODCD), Türk Ortopedi ve Travmatoloji Birliği Derneği (TOTBİD), Avrupa Spor Travmatolojisi Diz Cerrahisi ve Artroskopi Derneği (ESSKA), Avrupa Omuz ve Dirsek Cerrahisi Derneği (SECEC / ESSSE) gibi birçok ulusal ve uluslararası derneğin aktif üyesidir.
Türk Omuz ve Dirsek Cerrahisi Derneği’nde 2013–2015 ve 2015–2017 dönemlerinde Yönetim Kurulu Sekreteri, 2017–2019 ve 2025– dönemlerinde ise Yönetim Kurulu Üyesi olarak görev almıştır.
Dr. Akgün, spor travmatolojisi, artroskopik cerrahi ve omuz-diz cerrahisi alanlarında ulusal ve uluslararası düzeyde birçok bilimsel çalışmaya imza atmıştır. Dr. Akgün Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Ortopedi ve Travmatoloji Anabilim Dalı başkanlığını yapmakta, akademik ve klinik kariyerine aktif olarak devam etmektedir.